Gérée par l'association Transrock, le Krakatoa est l'une des meilleures salles de musiques amplifiées de l'agglomération bordelaise. La programmation représente en moyenne 5 à 6 concerts par mois. Le Krakatoa est aussi un espace de formations et de répétitions pour les artistes, d'expos, de culture multimédia et une pépinière pour les groupes locaux. Les soirs de concert, il y a des expositions de photo dans le hall d'accueil.